Dokumentasi dari Cekli PhotoLab dibuat menggunakan program gratis Doxygen. Doxygen menerjemahkan kode C++ dengan mencari komentar-komentar dan mencari struktur data dari program yang akan di dokumentasikan. Program C++ yang didokumentasikan dengan Doxygen harus mempunyai standar komentar tertentu.

Hasil penerjemahan oleh Doxygen dapat berbentuk file-file html, latex, rtf, dan sebagainya. Contoh dokumentasi yang dihasilkan oleh Doxygen dari kode sumber Cekli PhotoLab dapat dilihat di link ini.